Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Dhx40Q6PE54 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms