Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc85bQ6PDY0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms