Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbtb39Q6PDK0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbtb39Q6PDK0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbtb39Q6PDK0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbtb39Q6PDK0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbtb39Q6PDK0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbtb39Q6PDK0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zbtb39Q6PDK0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms