Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarcc2Q6PDG5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms