Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Herc4Q6PAV2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms