Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmgb4Q6P8W9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms