Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC061212Q6P8K3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms