Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tsen2Q6P7W5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tsen2Q6P7W5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tsen2Q6P7W5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms