Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Polr2mQ6P6I6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Polr2mQ6P6I6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Polr2mQ6P6I6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr2mQ6P6I6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2mQ6P6I6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms