Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf9bQ6NZA9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf9bQ6NZA9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf9bQ6NZA9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf9bQ6NZA9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf9bQ6NZA9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf9bQ6NZA9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf9bQ6NZA9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf9bQ6NZA9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf9bQ6NZA9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf9bQ6NZA9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf9bQ6NZA9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms