Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arhgap20Q6IFT4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arhgap20Q6IFT4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms