Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf8Q6DID3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms