Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbf1Q6DFZ1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gbf1Q6DFZ1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gbf1Q6DFZ1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbf1Q6DFZ1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbf1Q6DFZ1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbf1Q6DFZ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbf1Q6DFZ1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbf1Q6DFZ1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbf1Q6DFZ1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbf1Q6DFZ1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbf1Q6DFZ1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms