Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nop58Q6DFW4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nop58Q6DFW4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms