Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pdzrn3Q69ZS0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms