Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc8eQ66JT1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms