Protein–RNA interactions for Protein: Q640L3

Ccpg1, Cell cycle progression protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccpg1Q640L3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccpg1Q640L3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccpg1Q640L3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms