Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col4a5Q63ZW6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a5Q63ZW6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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