Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Kdm5dQ62240 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Kdm5dQ62240 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Kdm5dQ62240 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Kdm5dQ62240 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Kdm5dQ62240 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Kdm5dQ62240 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Kdm5dQ62240 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Kdm5dQ62240 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Kdm5dQ62240 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Kdm5dQ62240 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Kdm5dQ62240 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Kdm5dQ62240 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Kdm5dQ62240 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Kdm5dQ62240 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Kdm5dQ62240 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Kdm5dQ62240 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Kdm5dQ62240 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC39.44■■■■□ 3.91
Kdm5dQ62240 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
Kdm5dQ62240 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Kdm5dQ62240 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms