Protein–RNA interactions for Protein: Q62191

Trim21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim21Q62191 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim21Q62191 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim21Q62191 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms