Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Npm1Q61937 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Npm1Q61937 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Npm1Q61937 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms