Protein–RNA interactions for Protein: Q61805

Lbp, Lipopolysaccharide-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbpQ61805 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LbpQ61805 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LbpQ61805 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LbpQ61805 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LbpQ61805 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LbpQ61805 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LbpQ61805 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LbpQ61805 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbpQ61805 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbpQ61805 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LbpQ61805 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LbpQ61805 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms