Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NinQ61043 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NinQ61043 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NinQ61043 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NinQ61043 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NinQ61043 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NinQ61043 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NinQ61043 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NinQ61043 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NinQ61043 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NinQ61043 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NinQ61043 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NinQ61043 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NinQ61043 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NinQ61043 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NinQ61043 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NinQ61043 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NinQ61043 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NinQ61043 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NinQ61043 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NinQ61043 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NinQ61043 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NinQ61043 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NinQ61043 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NinQ61043 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NinQ61043 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NinQ61043 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NinQ61043 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NinQ61043 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NinQ61043 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NinQ61043 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NinQ61043 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NinQ61043 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinQ61043 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinQ61043 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinQ61043 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinQ61043 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinQ61043 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinQ61043 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NinQ61043 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NinQ61043 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NinQ61043 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NinQ61043 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NinQ61043 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NinQ61043 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NinQ61043 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NinQ61043 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NinQ61043 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NinQ61043 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NinQ61043 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NinQ61043 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NinQ61043 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NinQ61043 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NinQ61043 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NinQ61043 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NinQ61043 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NinQ61043 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NinQ61043 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NinQ61043 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NinQ61043 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NinQ61043 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NinQ61043 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NinQ61043 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NinQ61043 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NinQ61043 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NinQ61043 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NinQ61043 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NinQ61043 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NinQ61043 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NinQ61043 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NinQ61043 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NinQ61043 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NinQ61043 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NinQ61043 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NinQ61043 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NinQ61043 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NinQ61043 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NinQ61043 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NinQ61043 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NinQ61043 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NinQ61043 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NinQ61043 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NinQ61043 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NinQ61043 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NinQ61043 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NinQ61043 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NinQ61043 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NinQ61043 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NinQ61043 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NinQ61043 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NinQ61043 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NinQ61043 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NinQ61043 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NinQ61043 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NinQ61043 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NinQ61043 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NinQ61043 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NinQ61043 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NinQ61043 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NinQ61043 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms