Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik1Q60934 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik1Q60934 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms