Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atf3Q60765 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atf3Q60765 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms