Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mkrn3Q60764 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mkrn3Q60764 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mkrn3Q60764 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms