Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms