Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Utp20Q5XG71 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms