Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms