Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf1Q5U4C3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scaf1Q5U4C3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scaf1Q5U4C3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms