Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms