Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc42Q5SV66 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms