Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PfasQ5SUR0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PfasQ5SUR0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.1 ms