Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bod1Q5SQY2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Bod1Q5SQY2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bod1Q5SQY2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bod1Q5SQY2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bod1Q5SQY2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bod1Q5SQY2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bod1Q5SQY2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bod1Q5SQY2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bod1Q5SQY2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bod1Q5SQY2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bod1Q5SQY2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bod1Q5SQY2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bod1Q5SQY2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bod1Q5SQY2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bod1Q5SQY2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bod1Q5SQY2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bod1Q5SQY2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bod1Q5SQY2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms