Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85aQ5SP85 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms