Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PkdccQ5RJI4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PkdccQ5RJI4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms