Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlha9Q5RJB0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlha9Q5RJB0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms