Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scarf1Q5ND28 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms