Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam208bQ5DTT3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam208bQ5DTT3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms