Protein–RNA interactions for Protein: Q52KH6

Gm14685, DNA segment, Chr X, Baylor 18, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14685Q52KH6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm14685Q52KH6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm14685Q52KH6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm14685Q52KH6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm14685Q52KH6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm14685Q52KH6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm14685Q52KH6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm14685Q52KH6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm14685Q52KH6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm14685Q52KH6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm14685Q52KH6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm14685Q52KH6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm14685Q52KH6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms