Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc47Q505F5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc47Q505F5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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