Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxn3Q499D0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxn3Q499D0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxn3Q499D0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms