Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc185Q3V118 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc185Q3V118 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms