Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp48Q3V0C5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp48Q3V0C5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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