Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc160Q3UYG1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc160Q3UYG1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms