Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E330034G19RikQ3UWX6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E330034G19RikQ3UWX6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms