Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Capn13Q3UW68 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms