Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Obox3Q3UT54 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Obox3Q3UT54 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Obox3Q3UT54 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Obox3Q3UT54 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Obox3Q3UT54 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Obox3Q3UT54 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Obox3Q3UT54 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Obox3Q3UT54 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Obox3Q3UT54 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Obox3Q3UT54 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Obox3Q3UT54 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Obox3Q3UT54 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Obox3Q3UT54 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Obox3Q3UT54 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Obox3Q3UT54 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Obox3Q3UT54 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Obox3Q3UT54 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Obox3Q3UT54 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Obox3Q3UT54 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Obox3Q3UT54 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Obox3Q3UT54 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Obox3Q3UT54 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms