Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm28047Q3US59 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm28047Q3US59 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm28047Q3US59 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms