Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TceancQ3US16 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms